2 évolutions s'opèrent en parallèle en matière de logiciels :

• de plus en plus de logiciels promettent le chiffrement de bout en bout, rendant le fournisseur incapable d'accéder aux données de l'utilisateur (exemple: signal, réseau Matrix, Nextcloud avec chiffrement de bout en bout, etesync)
• de plus en plus de logiciels sont développés comme "applications web", servies depuis un site internet (exemple: le client Matrix element.io, Microsoft Office365, ...)

En l'état actuel des technologies, les deux objectifs ne sont pas totalement compatibles. Une application qui fait du chiffrement de bout en bout, si on y accède via le navigateur depuis un site internet tiers, sera vulnérable à une attaque sur ce site internet : un intrus peut modifier l'application de sorte à faire fuiter les clés de chiffrement de ceux qui l'exécutent dans l'intervalle, ou trouver une faille (type XSS) de façon à exfiltrer les clés de certain.e.s utilisateurs ou utilisatrices. À l'inverse, une application "desktop" sera moins rapidement attaquable : il faut que l'attaquant publie une version vérolée, puis que les utilisateurs mettent à jour, avant que l'attaque soit effective. Si la validité des mises à jour est contrôlée à l'aide d'un mécanisme de signature cryptographique (comme c'est le cas des mises à jour logicielles des distributions Linux), l'attaque est rendue encore plus compliquée.

Pour les applications web, l'équipe derrière eteSync propose une solution sous forme d'extension de navigateur qui vérifie la signature GPG des pages renvoyées par le serveur.